ทอมมี่ ลี โจนส์และวิล สมิธพบกันในภาพยนตร์แอ็คชั่นไซไฟฮิตถล่มทลายกับบทบุรุษในชุดดำเจ้าหน้าที่จัดระเบียบประชากรเอเลี่ยนที่มาอาศัยอยู่ในโลกของเรา! ด้วยความสามารถของเหล่าเอเลี่ยนที่แอบมาอยู่บนโลกปะปนกับมนุษย์ได้อย่างแนบเนียน เป็นหน้าที่ขององค์กรเอ็มไอบี ที่จะต้องควบคุมและดูแลความเรียบร้อยของผู้มาเยือนจากต่างดาวทั้งหลายให้เป็นความลับอยู่ต่อไป แต่เมื่อการตายของเอเลี่ยนตนหนึ่งเกิดขึ้นอย่างน่าสงสัยเจ้าหน้าที่เคย์ (โจนส์) ผู้หน่ายโลกและเจ้าหน้าที่เจย์ (สมิธ) คู่หูใหม่ไฟแรงต้องก้าวเข้ามาสืบสวนปริศนาโดยมีดร. ลอร่า วีเวอร์ (ลินดา) แพทย์หญิงสุดเซ็กซี่คอยให้ความร่วมมือพวกเขาพบว่ามันเป็นฝีมือของเอเลี่ยนร้าย (วินเซนต์ ดีโอโน ฟริโน) ที่ลักลอบเข้ามาด้วยจุดประสงค์อันตรายซึ่งเคย์กับเจย์จะต้องหาทางกำจัดมันก่อนที่โลกจะถูกทำลาย!

Men In Black follows the exploits of agents Kay (Jones) and Jay (Smith), members of a top-secret organization established to monitor alien activity on Earth. The two MIB find themselves in the middle of the deadly plot by an intergalactic terrorist (Vincent D'Onofrio) who has arrived on Earth to assassinate two ambassadors from opposing galaxies. K and J face a simple imperative: track down the interloper or the Earth will be destroyed. It's all in a day's work for the Men In Black.